O Nível 3 é o nível avançado de especialização no PU e prepara os profissionais para se tornarem formadores na sua instituição e coordenadores de equipas clínicas e/ou de investigação no PU.
Quem completar o Nível 3 obtém dupla certificação enquanto formador no PU pela Associação Portuguesa de Terapia do Comportamento e pelo Unified Protocol Institute (Boston, EUA) e é indicado como formador no website do UPI (https://unifiedprotocol.com/find-a-provider/#map).
O Nível 3 é efetuado pela Professora Doutora Maria Cristina Canavarro e decorre em formato individual.